Catégorie : École d’été

2025 École d’été en modélisation de la biodiversité

Posted by on in Activités de formation, École d'été

L’édition 2025 de l’école d’été sur la modélisation de la biodiversité aura pour thème « Coder la biodiversité : construire des scénarios avec un modèle d’écosystème global ». Accueillie cette année à l’Université de Colombie Britannique à Vancouver, l’école sera l’occasion d’approfondir vos connaissances en matière de modélisation de la biodiversité, dans une atmosphère informelle et conviviale.

Photo by Darren Tierney on Unsplash

Il a été suggéré que des modèles généraux d’écosystème pourraient éclairer les décisions politiques et améliorer notre compréhension de la biodiversité et de son fonctionnement. L’élaboration de tels modèles est toutefois une tâche ardue qui ne pourrait être réalisée qu’en équipe.

L’objectif général de cette édition de l’université d’été sur la modélisation de la biodiversité sera d’étudier les effets conjoints des changements de biodiversité et du changement climatique sur le fonctionnement des écosystèmes en utilisant une version personnalisée du modèle Madingley. Les personnes inscrites apprendront à collaborer sur un problème complexe de codage avec une équipe interdisciplinaire, et de ce fait, nous encourageons les personnes ayant des antécédents divers à poser leur candidature pour constituer ces équipes interdisciplinaires.

Prérequis

Pour toutes les candidatures :

  • Compétences en anglais de niveau intermédiaire; connaissance du français (un atout)
  • Être admissible à étudier au Canada (c.-à-d. avoir le visa approprié ou être exempté de cette exigence pour s’inscrire à un cours universitaire)

Pour les candidatures axées sur le développement de modèles de biodiversité :

  • Connaissance de base en modélisation de la biodiversité
  • Connaissances de niveau intermédiaire avancé en programmation scientifique (le programme mettra l’accent sur le langage R, mais vous pouvez utiliser le langage de votre choix)
  • Familiarité avec les systèmes de contrôle de version (une formation avancée est prévue pendant l’école d’été)

Pour les candidatures en communication sur les modèles de biodiversité :

  • Familiarité avec les sujets liés à la biodiversité
  • Compétences en matière de visualisation de données et/ou de communication et de vulgarisation dans différents médias
Date : du 18 au 22 août 2025 18 au 22 août 2025
Lieu : Université de la Colombie-Britannique, Vancouver - BC
Frais d'inscription : 600$ (sans hébergement) ou 950$ (avec hébergement)
Le prix comprend l'inscription au cours et les repas. Les membres de certains programmes ou associations peuvent bénéficier d'une aide financière pour participer à l'événement.

Inscription

Toute personne intéressée à participer à l’école d’été doit remplir ce formulaire avant le 15 juin 2025. L’inscription officielle (admission et paiement des frais d’inscription) aura lieu durant la semaine du 30 juin 2025.

Plus d’informations et inscription : https://www.usherbrooke.ca/ecoles-de-pointe/en/biology/2025-biodiversity-modelling

2025 École d’été en statistiques avancées en sciences de la vie

Posted by on in Activités de formation, École d'été

Les inscriptions sont ouvertes pour notre école d’été 2025 en statistiques avancées pour les sciences de la vie, cette année avec le thème « Modèles hiérarchiques pour les sciences de la vie ». Du 5 au 9 mai 2025, nous nous retrouverons au magnifique centre de villégiature de Jouvence à Orford, au Québec, pour apprendre de Guillaume Blanchet, Ph.D, et Andrew MacDonald, Ph.D, les modèles hiérarchiques avec et sans contraintes (par exemple, spatiales et/ou temporelles) ainsi que les modèles hiérarchiques multivariés.

Les participants sont invités à apporter leurs propres jeux de données et doivent avoir installé R sur leur ordinateur, ainsi qu’un niveau intermédiaire de connaissances en statistiques et en programmation scientifique.

Les personnes intéressées à participer à l’école d’été doivent remplir ce formulaire avant le 30 mars 2025.

Plus d’informations sur le site de l’Université de Sherbrooke.

2024 École d’été en statistiques avancées en sciences de la vie

Posted by on in Activités de formation, École d'été

L’École d’été en statistiques avancées en sciences de la vie, sur le thème de Modèles hiérarchiques, aura lieu du 29 avril au 3 mai 2024 à Jouvence, dans le parc national du Mont-Orford au Québec. Les modèles hiérarchiques dans les sciences de la vie font référence à des cadres statistiques qui tiennent compte de la structure imbriquée des données souvent rencontrée dans la recherche biologique, où les observations sont organisées à plusieurs niveaux de hiérarchie tels que les individus au sein des populations, ou les mesures répétées au sein des individus. Ces modèles permettent d’intégrer à la fois la variabilité au sein des groupes et entre les groupes, ce qui donne un aperçu des processus biologiques sous-jacents tout en tenant compte de manière appropriée des dépendances complexes au sein des données.

Le cours intensif est présenté par Pr Guillaume Blanchet, Université de Sherbrooke, et Dr. Andrew MacDonald, professionnel de recherche pour BIOS2, CREUS et CSBQ. Le cours a pour but d’introduire les modèles hiérarchiques autant d’un point de vue théorique que pratique. Le tout sera fait via R avec une introduction à Stan. Apportez votre jeu de données!

Inscription

Toute personne intéressée à participer à l’école d’été doit remplir ce formulaire avant le 20 mars 2024. L’inscription officielle (admission et paiement des frais d’inscription) aura lieu au cours de la semaine du 25 mars 2024.

Plus d’informations et inscription : https://www.usherbrooke.ca/ecoles-de-pointe/fr/biologie/2024-statistiques-avancees-sciences-vie

2024 École d’été sur la modélisation de la biodiversité

Posted by on in Activités de formation, École d'été

L’édition 2024 de l`école d’été sur la modélisation de la biodiversité aura pour thème « Indicateurs de suivi des changements de la biodiversité » . Les indicateurs de biodiversité sont des paramètres utilisés pour mesurer et évaluer la santé, la diversité et la distribution des espèces, des écosystèmes et de la variabilité génétique au sein d’un environnement. Ces indicateurs fournissent des indications précieuses sur l’état et les tendances de la biodiversité au fil du temps, contribuant à éclairer les efforts de conservation, l’élaboration des politiques et les pratiques de développement durable. En suivant ces indicateurs, les scientifiques et les décideurs politiques peuvent surveiller l’évolution de la biodiversité, identifier les zones préoccupantes, hiérarchiser les actions de conservation et évaluer l’efficacité des stratégies de conservation.

L’objectif principal du cours sera de développer un rapport sur l’état actuel de la biodiversité pour le Canada, basé sur les connaissances scientifiques les plus récentes en matière d’indicateurs de biodiversité et en utilisant des technologies de pointe dans le domaine de la science des données. 

Présenté par Pr Dominique Gravel (Université de Sherbrooke) en collaboration avec plusieurs scientifiques de premier plan dans le domaine, le cours intensif aura lieu du 13 au 17 mai 2024 à Jouvence, dans le parc national du Mont-Orford au Québec. 

Date : 13 au 17 mai 2024
Lieu : Centre de Villégiature Jouvence à Orford (Québec)
Coût : 600 $ (chambre partagée), 800 $ (chambre privée)
Le prix inclut l’inscription au cours, l’hébergement et les repas

Inscription

Les personnes intéressées à participer à l’école d’été doivent remplir ce formulaire au plus tard le 20 mars 2024. L’inscription officielle (admission et paiement des frais d’inscription) se fera dans la semaine du 25 mars 2024.

Plus d’informations et inscription : https://www.usherbrooke.ca/ecoles-de-pointe/fr/biologie/2024-modelisation-biodiversite

Atelier d’introduction à Python

Posted by on in Ateliers de formation, École d'été

Le programme de formation BIOS² propose un atelier d’introduction à Python pour les utilisateurs de R. L’atelier sera présenté les 15 et 16 mai 2023 par Vincent Beauregard, spécialiste des données à Biodiversité Québec.

Le cours vise à fournir les bases de Python et à familiariser les participants avec les outils et les bibliothèques pertinents pour l’écologie computationnelle. Les sessions s’appuieront sur les connaissances préalables des participants en langage R pour faciliter l’apprentissage. Les sujets abordés incluront la manipulation de données avec Pandas, la visualisation de données avec Matplotlib, et l’analyse de données avec Numpy et Scipy. Les étudiants apprendront également à décomposer leur code en fonctions et à travailler avec des classes en Python.

L’atelier est offert en préparation à l’École doctorale en écologie computationnelle, mais il est ouvert à tous les membres du programme BIOS2 et toutes autres personnes intéressées.

Instructeur

Vincent Beauregard est coordonnateur technique et spécialiste des infrastructures, des interfaces de données et des données de télédétection à Biodiversité Québec. Il s’intéresse à l’automatisation des schémas de traitement de données.

Quoi: Atelier d’introduction à Python

Quand: 15 et 16 mai 2023, 1 pm – 4 pm (votre heure ici)
Où: En ligne et à l’Université Laval
Langue: Anglais (Q&R et discussion bilingues)
Frais: gratuit – ouvert à tous
Date limite d’inscription: 11 mai 2023
Lien d’inscription: https://forms.office.com/r/kWvCrdpbus

École d’été en modélisation de la biodiversité 2022

Posted by on in Activités de formation, École d'été

L’édition 2022 de l’école d’été, qui se déroulera du 22 au 26 août 2022 au Centre de Villégiature Jouvence à Orford, portera sur le thème « Changements de la biodiversité et visualisation de données ». Le cours prendra la forme d’un atelier pendant lequel les personnes étudiantes, en collaboration avec des organisations locales impliquées dans le suivi de la biodiversité, développeront une plateforme web pour la visualisation des changements de la biodiversité.

Read More « École d’été en modélisation de la biodiversité 2022 »