2025 École d’été en modélisation de la biodiversité

L’édition 2025 de l’école d’été sur la modélisation de la biodiversité aura pour thème « Coder la biodiversité : construire des scénarios avec un modèle d’écosystème global ». Accueillie cette année à l’Université de Colombie Britannique à Vancouver, l’école sera l’occasion d’approfondir vos connaissances en matière de modélisation de la biodiversité, dans une atmosphère informelle et conviviale.

Photo by Darren Tierney on Unsplash

Il a été suggéré que des modèles généraux d’écosystème pourraient éclairer les décisions politiques et améliorer notre compréhension de la biodiversité et de son fonctionnement. L’élaboration de tels modèles est toutefois une tâche ardue qui ne pourrait être réalisée qu’en équipe.

L’objectif général de cette édition de l’université d’été sur la modélisation de la biodiversité sera d’étudier les effets conjoints des changements de biodiversité et du changement climatique sur le fonctionnement des écosystèmes en utilisant une version personnalisée du modèle Madingley. Les personnes inscrites apprendront à collaborer sur un problème complexe de codage avec une équipe interdisciplinaire, et de ce fait, nous encourageons les personnes ayant des antécédents divers à poser leur candidature pour constituer ces équipes interdisciplinaires.

Prérequis

Pour toutes les candidatures :

  • Compétences en anglais de niveau intermédiaire; connaissance du français (un atout)
  • Être admissible à étudier au Canada (c.-à-d. avoir le visa approprié ou être exempté de cette exigence pour s’inscrire à un cours universitaire)

Pour les candidatures axées sur le développement de modèles de biodiversité :

  • Connaissance de base en modélisation de la biodiversité
  • Connaissances de niveau intermédiaire avancé en programmation scientifique (le programme mettra l’accent sur le langage R, mais vous pouvez utiliser le langage de votre choix)
  • Familiarité avec les systèmes de contrôle de version (une formation avancée est prévue pendant l’école d’été)

Pour les candidatures en communication sur les modèles de biodiversité :

  • Familiarité avec les sujets liés à la biodiversité
  • Compétences en matière de visualisation de données et/ou de communication et de vulgarisation dans différents médias
Date : du 18 au 22 août 2025 18 au 22 août 2025
Lieu : Université de la Colombie-Britannique, Vancouver - BC
Frais d'inscription : 600$ (sans hébergement) ou 950$ (avec hébergement)
Le prix comprend l'inscription au cours et les repas. Les membres de certains programmes ou associations peuvent bénéficier d'une aide financière pour participer à l'événement.

Inscription

Toute personne intéressée à participer à l’école d’été doit remplir ce formulaire avant le 15 juin 2025. L’inscription officielle (admission et paiement des frais d’inscription) aura lieu durant la semaine du 30 juin 2025.

Plus d’informations et inscription : https://www.usherbrooke.ca/ecoles-de-pointe/en/biology/2025-biodiversity-modelling

2025 École d’été en statistiques avancées en sciences de la vie

Les inscriptions sont ouvertes pour notre école d’été 2025 en statistiques avancées pour les sciences de la vie, cette année avec le thème « Modèles hiérarchiques pour les sciences de la vie ». Du 5 au 9 mai 2025, nous nous retrouverons au magnifique centre de villégiature de Jouvence à Orford, au Québec, pour apprendre de Guillaume Blanchet, Ph.D, et Andrew MacDonald, Ph.D, les modèles hiérarchiques avec et sans contraintes (par exemple, spatiales et/ou temporelles) ainsi que les modèles hiérarchiques multivariés.

Les participants sont invités à apporter leurs propres jeux de données et doivent avoir installé R sur leur ordinateur, ainsi qu’un niveau intermédiaire de connaissances en statistiques et en programmation scientifique.

Les personnes intéressées à participer à l’école d’été doivent remplir ce formulaire avant le 30 mars 2025.

Plus d’informations sur le site de l’Université de Sherbrooke.

Atelier R et Git : Du code à la collaboration

BIOS2 organise un atelier d’une journée sur la programmation et le contrôle de versions pour la science des données et la recherche. Nos instructeurs Carpentries certifiés Francis Banville et Gabriel Dansereau donneront une introduction au Tidyverse, une collection de libraires R pour la manipulation et la visualisation des données. Ils présenteront également Git, un outil de collaboration et de contrôle de versions utile pour le travail en recherche. Les leçons couvertes seront inspirées de celles développées par The Carpentries (Data Analysis and Visualization in R for Ecologists et Version Control with Git). 

L’atelier est gratuit et se déroulera en personne au Campus MIL de l’Université de Montréal (avec collations !) et la langue d’enseignement sera le français. Le nombre de places est très limité, alors inscrivez-vous rapidement !

Vous devez avoir installé R et RStudio ainsi que Git Bash avant l’atelier. Si vous avez besoin d’aide pour l’installation, veuillez envoyer un courriel à Francis ou Gabriel, ou arrivez 60-30 minutes avant le début de l’atelier.

Quoi : Atelier sur R (Tidyverse) et Git 
Quand : Samedi 18 janvier de 9:00 à 17:00
: Campus MIL (Université de Montréal), local B-2061
Contacts : Francis Banville (francis.banville [at] umontreal.ca) et Gabriel Dansereau (gabriel.dansereau [at] umontreal.ca) 

Formulaire d’inscription :

Blog: A Journey with Data Trekkers

Story of an internship by Gracielle Higino, Gabriel Dansereau and Francis Banville

Back in 2019, which feels like decades ago, we started a humble project in the Poisot lab which we called Code Hour. The goal was to set weekly hours to practice Julia, since we were all learning to use it and we could greatly benefit from each other’s help and encouragement. The project went well (although we frequently ended up spending much more than one hour). It « spilled » out of our lab and found enthusiasm at IVADO, who already had plans to promote a challenge in which participants would make a commitment to code for 100 days. That’s when our internship was born.