Catégorie : Activités de formation

Deux ateliers pour démarrer votre projet de données

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Nouvelle année, nouveau projet ! En février, BIOS2 proposera deux ateliers pour vous aider à démarrer vos projets de données : Mise en place des projets et Manipulation des données. Dans un mélange de conseils sur les meilleures pratiques, de tutoriels et d’activités de support, ces ateliers très basiques sont conçus pour vous faire réfléchir à l’organisation de votre projet et de vos données avant de commencer quoi que ce soit, mais aussi pour vous aider à remodeler vos projets en cours vers quelque chose de plus organisé et reproductible. Les inscriptions sont ouvertes jusqu’à deux jours avant le premier jour de chaque atelier, et les places sont limitées (max. 40 personnes par atelier).

Ces ateliers devraient être accessibles à tout étudiant diplômé, bien qu’une expérience préalable de R soit utile. L’atelier se déroulera en anglais, avec un support en français, et sera présenté en ligne. Le lien pour y accéder sera communiqué peu avant l’atelier.

Pour vous inscrire, remplissez ce formulaire : https://forms.office.com/r/Y1Bs5VuTJh

Mise en place des projets

Apprenez et pratiquez l’organisation de projet, les conseils de reproductibilité, la maintenance de projet, et plus encore !
Instructeurs : Andrew MacDonald et Gracielle Higino
Quand : 5, 6 et 7 février à 11 heures (heure de Paris) / 14 heures (heure de l’Est)
Où : en ligne

Manipulation des données

Apprenez les meilleures pratiques sur le nettoyage des données et suivez un tutoriel sur OpenRefine.
Instructeurs : Simran Bains, Lukas Van Riel et Timothée Poisot
Quand : 13 et 15 février à 10h PT / 13h ET
Où : en ligne

Si vous avez des questions, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse pgm_bios2@usherbrooke.ca.

Conseils pratiques pour la modélisation statistique

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Lorsqu’il s’agit de concevoir un modèle statistique, beaucoup d’incertitudes viennent à l’esprit. En décembre, BIOS2 offrira un atelier qui vous donnera quelques stratégies utiles pour ajuster et comprendre vos modèles de régression. Animé par Dr Andrew MacDonald, l’atelier se déroulera pendant 3h en deux jours, les 12 et 14 décembre 2023, avec beaucoup de temps pour les questions et les discussions sur votre propre travail. Cet atelier devrait être accessible à tout étudiant diplômé, bien qu’une expérience préalable de R soit utile. L’atelier se déroulera en anglais, avec un soutien en français.

Pour vous inscrire, remplissez le formulaire lié à la fin de cette page avant le 9 décembre 2023.

Programme

Jour 1:

  • Qu’est-ce que le zéro ? Quand et comment centrer une variable ?
  • Quelles sont les unités ? La mise à l’échelle d’une variable et pourquoi il faut le faire.
  • Qu’est-ce que cela signifie ? Faire des prédictions.
  • Est-ce que cela dépend ? Ajustement et visualisation des interactions.

Jour 2:

  • Quelles sont vos expectatives ? Simuler des ensembles de données.
  • L’arme secrète : ajuster le même modèle plusieurs fois.
Quand : 13h EST, mardi 12 décembre et jeudi 14 décembre 2023.
Durée : 3h chaque jour (6 heures au total)
Où : En ligne - les informations seront envoyées le jour précédent 
Formulaire d'inscription : https://forms.office.com/r/BfUD8Gv61D
Date limite d'inscription :  9 décembre 2023

Apprentissage automatique interprétable appliqué aux MDS

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L’apprentissage automatique n’est pas une boîte noire (à moins que nous le voulions !). Si vous vous êtes déjà demandé ce que les résultats d’un modèle de distribution des espèces signifient réellement, BIOS² est là pour vous aider ! Le 6 octobre 2023, de 13h à 15h EDT, le professeur Timothée Poisot animera un atelier court et très participatif sur la façon d’interpréter les modèles d’apprentissage automatique appliqués aux SDM.

Dans cet atelier, les participants construiront un modèle simple pour prédire la distribution du raton laveur dans le sud du Québec à partir d’observations. Plutôt que de se concentrer sur la prédiction, nous poserons des questions sur le pourquoi. Plus précisément, en combinant la présentation des résultats avec des discussions en petits groupes, nous nous interrogerons sur le fonctionnement du modèle, sur le moment où il est acceptable d’appliquer notre meilleur jugement et d’ignorer certaines mesures de performance, et sur la façon dont nous pouvons envisager l’apprentissage automatique interprétable pour améliorer la transparence du modèle. Les participants auront accès à l’ensemble du code et des données à la fin de l’atelier.

L’atelier sera organisé virtuellement et les informations concernant l’accès seront envoyées aux participants inscrits un jour avant l’événement.

Pour poser votre candidature, veuillez remplir ce formulaire avant le 4 octobre 2023 : https://forms.office.com/r/SLuu3gv9B1

Atelier d’introduction à Python

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Le programme de formation BIOS² propose un atelier d’introduction à Python pour les utilisateurs de R. L’atelier sera présenté les 15 et 16 mai 2023 par Vincent Beauregard, spécialiste des données à Biodiversité Québec.

Le cours vise à fournir les bases de Python et à familiariser les participants avec les outils et les bibliothèques pertinents pour l’écologie computationnelle. Les sessions s’appuieront sur les connaissances préalables des participants en langage R pour faciliter l’apprentissage. Les sujets abordés incluront la manipulation de données avec Pandas, la visualisation de données avec Matplotlib, et l’analyse de données avec Numpy et Scipy. Les étudiants apprendront également à décomposer leur code en fonctions et à travailler avec des classes en Python.

L’atelier est offert en préparation à l’École doctorale en écologie computationnelle, mais il est ouvert à tous les membres du programme BIOS2 et toutes autres personnes intéressées.

Instructeur

Vincent Beauregard est coordonnateur technique et spécialiste des infrastructures, des interfaces de données et des données de télédétection à Biodiversité Québec. Il s’intéresse à l’automatisation des schémas de traitement de données.

Quoi: Atelier d’introduction à Python

Quand: 15 et 16 mai 2023, 1 pm – 4 pm (votre heure ici)
Où: En ligne et à l’Université Laval
Langue: Anglais (Q&R et discussion bilingues)
Frais: gratuit – ouvert à tous
Date limite d’inscription: 11 mai 2023
Lien d’inscription: https://forms.office.com/r/kWvCrdpbus

Atelier sur l’évaluation des impacts environnementaux à Hydro-Québec

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BIOS² et Hydro-Québec s’associent pour proposer un atelier sur l’évaluation des impacts environnementaux le 4 mai 2023 à 1pm EDT (votre heure ici). Cet atelier est gratuit et ouvert à toute personne intéressée, et il fait partie de la formation offerte aux stagiaires du programme de formation BIOS².

La séance sera une visite guidée de la perspective d’Hydro-Québec sur l’implication des biologistes dans les grands projets hydroélectriques. Les principales étapes du processus d’évaluation des impacts environnementaux seront illustrées à l’aide de multiples exemples de projets qui ont favorisé la biodiversité et qui ont été inspirés par le domaine de l’écologie appliquée.

Cet atelier est le premier d’une série d’activités qui sera fait en collaboration avec Hydro-Québec. À l’automne, BIOS² organisera un groupe de travail qui aura comme objectif de proposer des solutions pour mieux intégrer des connaissances en écologie et des données de biodiversités aux études d’impacts environnementaux d’Hydro-Québec. Le groupe de travail se réalisera en consultation avec des acteurs pertinents et en collaboration avec des biologistes travaillant à Hydro-Québec. Les stagiaires intéressés à participer à ce groupe de travail sont fortement encouragés à vernir à l’atelier proposé le 4 mai.

Formateurs

Alexandre Beauchemin travaille pour Hydro-Québec depuis 2004. Il a étudié la biologie à l’Université McGill et a obtenu une maîtrise en sciences de l’environnement de l’Université du Québec à Montréal.
Amélie Drolet a étudié la biologie de la faune à l’Université McGill et a obtenu une maîtrise en biologie de l’Université Laval. Après avoir obtenu son diplôme, elle a travaillé plusieurs années en consultation avant de se joindre à Hydro-Québec en 2021.

Quoi: Atelier « Évaluation de l’impact sur l’environnement »
Quand: May 4, 2023 @ 1pm – 3pm EDT (votre heure ici)
Où : En ligne
Langue : Anglais (questions-réponses et discussions bilingues)
Tarifs : gratuit (les places sont limitées).
Date limite d’inscription : 3 mai 2023
Lien d’inscription : https://forms.office.com/r/MpYunysQLw

Sensibilisation aux réalités autochtones et recherche collaborative

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BIOS² propose une série de deux ateliers sur la sensibilisation aux réalités autochtones et la recherche collaborative en contexte autochtone. Ces formations visent à faire comprendre le contexte historique qui a marqué les relations entre les Autochtones et non Autochtones au Canada, dans le but de développer un environnement de respect et de collaboration. Les ateliers seront offerts en ligne par Catherine-Alexandra Gagnon (Érébia) les 18 et 19 avril prochains (2023).

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